只有神知道的世界第一季幕府后期，日本史上相当有人气的其中一个团体，一方面也是令勤王志士们闻风丧胆的年轻集团－新选组。以局长近藤勇为主轴，日本的未来就寄托在他们身上，是描述贯彻自己的信念的幕末青春物语。